咸鰳魚是浙東地區(qū)的傳統(tǒng)腌魚制品,因其肉質(zhì)鮮 美且具獨(dú)特的“霉”香味而備受當(dāng)?shù)鼐用竦南矏?。其?工是以新鮮鰳魚為原料,不去除魚鱗、魚鰓及內(nèi)臟,經(jīng) 3 次加鹽腌制而成,加鹽量通常在 30 %~50 %。腌魚生 產(chǎn)過程實(shí)質(zhì)上是一個(gè)復(fù)雜微生態(tài)體系在人為控制鹽 度、發(fā)酵溫度、濕度條件下,使微生物群落結(jié)構(gòu)及功能 趨于人們期望的方向演化的過程。
1 材料與方法
1.1 材料與試劑
咸鰳魚:購于舟山、寧波、杭州蕭山水產(chǎn)品批發(fā)市 場,各采集 2 種樣品,依次編號為 A(腌制 90 d,25 ℃開 放腌制)、B(-18 ℃凍藏)、C(室溫 22 ℃攤放)、D(室溫 22 ℃攤放)、E(室溫 22 ℃攤放)、F(室溫 22 ℃攤放)。除 舟山市場采集的 A 樣品為商販自制咸鰳魚外,其余產(chǎn) 品均為東南亞進(jìn)口咸鰳魚。 2216E 培養(yǎng)基:青島海博生物技術(shù)有限公司;DNA 提取試劑盒:北京莊盟生物科技有限公司;E.Z.N.A. R Stool DNA Kit、Taq DNA 聚合酶、DL2000 Marker:TaKaRa 寶成試劑有限公司。
1.2 主要儀器
超凈工作臺 SW-CJ-1CU、蒸汽壓力滅菌鍋 YXQSG46-280SA:上海博訊實(shí)業(yè)有限公司;高速冷凍離心 機(jī) 5810R:英國艾本德公司;超微量分光光度計(jì) MN913、高速聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction, PCR)儀 A24811:美國賽默飛世爾公司;凝膠電泳系統(tǒng) Tanon EPS600、凝膠成像系統(tǒng) Tanon 4200:上海天能科技有限公司。
1.3 方法
采集鰳魚鰓后部、背部及腹部肉,剪碎混勻。同種 樣品挑選體態(tài)大小一致、個(gè)體完整的 3 尾魚,將其魚肉 混勻,稱取 25 g 魚肉樣品至含 225 mL 生理鹽水的錐 形瓶中,震蕩混勻后制備梯度稀釋液,并涂布于 2216E 培養(yǎng)基。選擇適宜的稀釋度進(jìn)行菌落計(jì)數(shù),并隨機(jī)挑 取 40 個(gè)菌落,純化 2 次~3 次后,接種于相應(yīng)的液體培 養(yǎng)基中,靜置培養(yǎng) 24 h~48 h,制備 30 %的甘油菌液, -80 ℃凍藏備用。取 2216E 肉湯活化好的菌液 2 mL,按照試劑盒說 明書操作,提取菌株基因組 DNA。參考袁開等方法, 對分離菌株 16S rDNA 序列進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物測序 工作由南京金斯瑞生物科技有限公司完成,基因序列 于 GenBank 中進(jìn)行 BLAST 比對分析,部分序列結(jié)果提 交至 NCBI Genebank 數(shù)據(jù)庫。
2 結(jié)果與分析
采用 2216E 培養(yǎng)基對各樣品中可培養(yǎng)微生物進(jìn) 行了計(jì)數(shù)與分離,咸鰳魚樣品在 2216E 培養(yǎng)基上的菌落數(shù)量集中分布于 4.9 log CFU/100 g~5.2 log CFU/100 g。 每組樣品隨機(jī)挑取 40 個(gè)菌落,經(jīng)兩次純化后,從 A、C、 D、E、F 組樣品中共分離到 151 株可培養(yǎng)菌 (B 組樣品 微生物傳代后均未生長)。分離菌株經(jīng)過提取基因組、 擴(kuò)增獲得 16S rDNA 序列,測序結(jié)果經(jīng)與美國國立生 物技術(shù)信息中心(National Center for Biotechnology In- formation,NCBI)數(shù)據(jù)庫比對分析,將其鑒定至種、屬 水平,具體結(jié)果見表 3。將部分序列提交至 Genebank 數(shù)據(jù)庫,獲取序列編號為 MK205156~MK205178。芽孢桿菌屬是一類廣泛分布在土壤和水圈中的 細(xì)菌,在海洋環(huán)境中有大量分布。市售咸鰳魚中的芽 孢桿菌屬細(xì)菌,可能來源于鰳魚自身的生存環(huán)境,也 可能在加工或保藏中混入。通常情況下,添加米飯等 淀粉質(zhì)原料的發(fā)酵魚制品生產(chǎn)中,芽孢桿菌屬細(xì)菌會(huì) 成為優(yōu)勢菌,并且具有較為豐富的多樣性。在高鹽 腌制海產(chǎn)品中,枯草芽孢桿菌僅可能少量存在于產(chǎn)品 中。A、D、E、F 組樣品中,枯草芽孢桿菌數(shù)量占據(jù)絕對 優(yōu)勢。咸鰳魚加工原料中未加入淀粉質(zhì)原料,且加鹽 量達(dá)魚體重的 30 %~50 %,因此,大量的芽孢桿菌可能 來源于生產(chǎn)后的貯藏或運(yùn)輸中。
3 討論
基于分離培養(yǎng)研究技術(shù)從市售咸鰳魚中獲得 151 株可培養(yǎng)微生物,16S rDNA 序列分析顯示,分離菌株 可歸至 14 個(gè)屬和 23 個(gè)種。芽孢桿菌屬細(xì)菌是 A、D、 E、F 組樣品中優(yōu)勢微生物;C 組樣品中葡萄球菌為優(yōu) 勢菌,嗜冷桿菌和芽孢桿菌數(shù)量次之。上述 3 個(gè)屬以 外的其他種屬細(xì)菌在各類樣品中均呈零星分布的狀 態(tài)。然而,免培養(yǎng)高通量測序結(jié)果在屬水平上反映出 的微生物種類與分離培養(yǎng)方法不盡相同。Illumina MiSeq 測序結(jié)果顯示,C、D、E、F 組 中 狹 義 梭 菌 屬 (Clostridium sensu stricto)和分類梭菌科(Clostridiaceae unclassified)微生物數(shù)量最多是其中的主要優(yōu)勢菌,而 A 組樣品中堿桿菌屬 (Alkalibacillus)、嗜鹽古生菌 (Natrinema) 幾乎占據(jù)了主導(dǎo)地位,B 組樣品則以慢性 芽孢桿菌屬(Lentibacilus)為主。
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